Cioè se tu colleghi un solo hard disk all'hub e l'hub all'AGA funziona, poi quando colleghi il secondo non va più neanche il primo, oppure quello continua a funzionare? Sarebbe anche interessante leggere i messaggi su console per capire cosa non va (mi pare che siano visibili nel log del router, se non si ha un'interfaccia seriale). E fare quelle prove che ho postato in passato da qualche parte, per verificare quale punto del meccanismo non funziona.
Chi si occupa del montaggio delle partizioni e della conseguente configurazione di Samba è il modulo hotplug. E questo è fatto in modo da supportare più partizioni e più dischi (roleo, correggimi se sbaglio).